Sie hatten Geschäftsverbindungen nach Marienwerder und waren als Filialgemeinde Garnsee der Synagogengemeinde Marienwerder, die seit 1852 bestand, zugeordnet. Die jüdische Gemeinde Garnsee besaß zwar keine eigene Synagoge, dafür aber eine Betstube, die sich im Doppelhaus des Eisenwarenhändlers Friedrich Gehrke in der Graudenzer Strasse 1 im ersten Stock befand. Sie wurde durch eine Holztreppe vom Hof aus betreten.
Die jüdischen Einwohner von Garnsee hatten aber ihren eigenen Friedhof. Er wurde von Rabbiner Dr. Neufeld aus Elbing 1938 inspiziert und die Ergebnisse an die zuständige jüdische Gemeinde in Marienwerder weitergegeben. Neufeld berichtet: „Der Friedhof hat ein festes Steintor, das sogar verschlossen ist, jedoch erübrigt sich dieser Verschluss, denn es ist keine Mauer, keine Hecke, kein Zaun. Infolgedessen sind die in keiner Weise geschützten Gräber zum Teil schon umgeworfen.“
Neufeld ermittelte elf Grabstellen und machte eine Abschrift von allen noch lesbaren Grabsteinen. Die früheste Bestattung war demzufolge die von Lewin Simonsohn, gestorben am 18. Januar 1862. Es ist aber davon auszugehen, dass der Friedhof deutlich früher, vermutlich schon 1812, angelegt wurde. Der Friedhof lag auf einem kleinen Hügel in der Nähe des Kamin-Sees. Nur Reste des Hügels sind bis heute erhalten geblieben. 1938 wurde dort ein Sportplatz angelegt, der 1967 ausgebaut
wurde.

Über die Lage des Friedhofs gibt ein Meßtischblatt von 1913 Auskunft.